Mrdakovic şi-a început cariera la juniorii echipei Radnicki Nis, din oraşul natal, apoi s-a transferat la Partizan Belgrad.

Atacantul a jucat la numeroase cluburi, printre care Anderlecht şi Gent, în Belgia, Salzburg (Austria), Maccabi Tel Aviv, Vitoria Guimaraes (Portugalia), Apollon Limassol şi AEK Larnaca (Cipru). În ţara sa, el a mai fost legitimat la Vojvodina Novi Sad, Rad Belgrad şi OFK Beograd, la ultima încheindu-şi cariera în 2017.

Datorită evoluțiilor sale din Cipru, fiind golgeterul sezonului, cu 21 de reușite, Mihai Stoica a dorit să-l aducă la FCSB pe atacantul sârb, în 2011.

Mrdakovic a avut 9 selecţii pentru naţionala U-21 a ţării sale și a disputat trei meciuri pentru echipa olimpică a Serbiei la Jocurile din 2008 de la Beijing.