Sfântul Emilian a slujit ca episcop al cetății Cizic (în sudul Mării Marmara), în timpul împăratului iconoclast Leon al V-lea Armeanul (813-820).
Cu prilejul discuției despre închinarea la sfintele icoane, pe care împăratul o convoacă în 815, Sfântul Emilian îl înfruntă pe Leon, spunându-i că problema dogmelor este o chestiune pur eclezială și de aceea trebuie rezolvată în interiorul Bisericii, fără amestecul autorităților laice. Nedorind să se supună decretelor date de acesta, prin care icoanele trebuiau scoase din biserici, Emilian a fost supus la chinuri grele și apoi a fost trimis în exil. După cinci ani a trecut la cele veșnice, existând bănuiala că a fost asasinat de oamenii împăratului.